2000年正是李慧珍事业的飞速发展的时期,然而就在李慧珍最走红时,却被确诊为脑垂体肿瘤,为了治病,李慧珍不得不暂停了歌唱事业,接受手术治疗。为了将来能继续唱歌,李慧珍付出了很大的牺牲,在手术之前险些失明,却永远失去了生育能力,这是女人一辈子最大的遗憾。当时24岁的李慧珍,也许觉得相比于她的歌唱事业影响生育并不算是件多大的事,年龄渐长,她才真正明白,这个伤痛对她和她的感情生活带了多么大的影响。
大病愈之后的李慧珍依然伤痕累累。她开始思考自己今后的发展方向。她选择了与这个她混迹多年的圈子息息相关的工作——开起了自己的经纪公司,为香港的许多知名艺人打理在内地的工作,包括钟丽缇、苏永康、张卫建等等。最后,李慧珍甚至放弃了唱歌,转而为钟丽缇、苏永康、张卫健打理内地演艺业务。